La Fundación Zoo de Santillana es una organización sin ánimo de lucro creada el 5 de febrero de 2007 por iniciativa de José Ignacio Pardo de Santayana, Director del Zoológico de Santillana del Mar con motivo del 30 Aniversario del Zoo.
Esta Fundación tiene por objetivo la promoción, difusión y divulgación de valores relacionados con el cuidado y la conservación de la naturaleza, de la flora, la fauna y del medio ambiente.
Tanto los Programas de Conservación que se llevan a cabo en el Zoo de Santillana como de Investigación o el Programa Educativo, tienen lugar dentro del marco de esta Fundación.
El patronato de la Fundación Zoo de Santillana está formado por:
Excelentísimo Ayuntamiento de Torrelavega
Excelentísimo Ayuntamiento de Santillana del Mar
Museo y Centro de Investigación de Altamira
Universidad de Cantabria
D. Francisco Ballester Muñoz, Universidad de Cantabria
Dña. Mª Isabel Angulo Bustamante, como Vicepresidenta
D. José Ignacio Pardo de Santayana, como Fundador y Presidente